การรบกวนของจุลินทรีย์ในระบบทางเดินอาหาร (GI) อาจมีบทบาทสำคัญในพยาธิสรีรวิทยาของความผิดปกติของระบบทางเดินอาหาร โปรไบโอติกถูกนำมาใช้เป็นวิธีการรักษามานานกว่าศตวรรษ พวกเขาอาจฟื้นฟูจุลินทรีย์แบคทีเรียปกติและส่งผลต่อการทำงานของระบบทางเดินอาหารด้วยกลไกต่างๆ ปัจจุบันโปรไบโอติกไม่ได้รับการควบคุมและมีการทดลองแบบสุ่มที่มีกลุ่มควบคุมเพียงไม่กี่รายการเท่านั้นที่ตรวจสอบประสิทธิภาพของโปรไบโอติกในความผิดปกติของ ไบโอติกส์ ระบบทางเดินอาหารต่างๆ มีอยู่ในสูตรผสมและระบบการนำส่งที่หลากหลาย ทำให้การตีความและการเปรียบเทียบการศึกษาทำได้ยากยิ่งขึ้น ประสิทธิภาพของโปรไบโอติก ไม่ว่าจะเป็นสายพันธุ์เดียวหรือหลายโปรไบโอติกร่วมกัน ได้รับการทดสอบในโรคอุจจาระร่วงที่เกี่ยวข้องกับยาปฏิชีวนะ, Clostridium difficileลำไส้ใหญ่อักเสบ ท้องร่วงติดเชื้อ ลำไส้ใหญ่อักเสบเป็นแผล โรคโครห์น โรคกระเป๋าอักเสบ และโรคลำไส้แปรปรวน รวมถึงความผิดปกติอื่นๆ ผลลัพธ์ของการศึกษาได้รับการทบทวนในบทความนี้และมีการจัดทำคำแนะนำสำหรับการใช้โปรไบโอติกในความผิดปกติเหล่านี้ แม้ว่าโดยทั่วไปแล้วโปรไบโอติกจะดูเหมือนปลอดภัยในการตั้งค่าผู้ป่วยนอก แต่สถานการณ์อาจแตกต่างออกไปในผู้ป่วยที่มีภาวะภูมิคุ้มกันบกพร่องและเข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลซึ่งอาจมีความเสี่ยงสูงในการเกิดภาวะติดเชื้อจากโปรไบโอติก ไม่มีการศึกษาใดที่กล่าวถึงประเด็นด้านความปลอดภัยโดยเฉพาะ คำถามมากมายเกี่ยวกับการใช้โปรไบโอติกในความผิดปกติของระบบทางเดินอาหารยังคงได้รับคำตอบในการศึกษาในอนาคต เช่น ปริมาณที่เหมาะสมที่สุด ระยะเวลาการรักษา ผลกระทบทางสรีรวิทยาและภูมิคุ้มกัน ประสิทธิภาพของโปรไบโอติกเฉพาะในสภาวะโรคเฉพาะ และความปลอดภัยในผู้ป่วยที่ร่างกายอ่อนแอ